作者：连彬（Bin Lian）· ORCID 0000-0002-1477-9137 · drmilo@gkd.edu.cn 首发：2026-09-21 · 源仓库：https://github.com/speetle/SCI-writing-VIP 许可：个人非商业使用；转载须完整保留本署名；禁止移除署名、禁止重新打包发布（见
LICENSE）。© 2026 连彬 (Bin Lian). All rights reserved.
可持续自我迭代型生物医药 SCI 科研助手 —— 用真实 PubMed 文献训练「如何表述问题」，而不是套用通用模板。
A self-iterating SCI writing assistant for biomedical research (no field restriction — bioinformatics is only one of many). It learns how human scientists frame problems and assert claims from real PubMed literature, instead of applying generic templates.
一个 WorkBuddy / Agent Skill。它把「英文论文写作能力」拆成一套可重复执行的日循环与周循环，靠三个机制逼近真人写作水平：
- 样本 A / 样本 B 对照 —— 样本 A 是 PubMed 真人原文，样本 B 是自己产出的文本。所有诊断都是 A 与 B 的量化对照。
- 累积型知识库 —— 每周的收获落成可复用条目（句式、衔接范式、结构规则、错题），下次训练前先读。
- 问题表述优先于指标对齐 —— 机器检测的 hedge 密度等分布指标是次要的；先看人敢不敢下判断（见下节）。
| 层 | 产物 | 时间窗 / IF | 规模 | 用途 | 硬约束 |
|---|---|---|---|---|---|
| ① 周课主池 | 01_文献库/<周次>/papers_master.csv |
近 1 年 / 全分层 | ≥500 篇 / 周 | 保量归档、热点速览 | 10 个检索块覆盖全生物医药；IF 分层不得有 UNBINNED |
| ② 顶刊 reserve 池 | 01_文献库/_顶刊池/papers_toppool.csv |
近十年 2016–2026 / IF>20 / 三大顶刊系为主 | ~470 篇 / 已建成 | 日课仿写头号素材源；学人类如何表述问题；周课深拆候选 | IF 未取到一律 PENDING（刊名硬门槛豁免的除外，此时 if_bin=UNBINNED，不得写 IF 数值） |
| ③ 当日清单 | 01_文献库/<周次>/D0n/ |
同 ① | ≥74 篇 / 日 | 当日七阶段的输入 | 全周并集必须等于池总数，重复 0 篇 |
两条不可动摇的分工：
- 保量走 ①，学表述走 ②，二者不可互换。 不能把「日课全改成 IF>20」字面执行——实测主池 520 篇里 IF>20 只有 11 篇，远低于每日 74 篇的硬要求（其中仅 3 篇有 PMCID）。
- 时间窗不统一，且不可合并： 周课前沿快报的热点固定近 2 年（时间敏感）；顶刊池取近十年（文体敏感，要看断言强度的年代演变）。
| 节奏 | 内容 | 频率 | 推送 |
|---|---|---|---|
| 日课 | 七阶段：取材 → 归档 → 语言范式提取 → 选材 → 仿写初稿 → 句级差异诊断 → 两轮修订 → 沉淀 | 每日（≥74 篇文献） | 静默：只落盘，不推送日报 |
| 周课 | 三件套：领域前沿研究快报（Word）＋ IMRAD 架构扫面（50 篇）+ 全文深拆（≤2 篇）＋ 写作框架模板升版 | 每周 1 次 | 《本周热点》（一页四块） |
《本周热点》是使用者每周收到的唯一一条消息，四块内容：① 本周热点 ② 本周练了什么 ③ 新进四库 ④ 短板与下周专项。它单独成页，不并入 Word 报告。
AI 写作最常见的毛病不是「不地道」，是太过保守——数据明明支持，却写成 "may potentially be associated with"。人类学者不会这样。因此诊断的第一维度不是连读率，而是：
| 维度 | 看什么 | 落到哪个库 |
|---|---|---|
| P1 问题命名 | 首句是否把问题点名，还是绕了一圈铺垫 | C_真人写作习惯 |
| P2 断言强度 | 结论用 drives / confirms / decreased 还是 might / could |
C_真人写作习惯 |
| P3 免责形态 | 免责是一句还是连环套（不构成／不等于／宁可不…） | D_AI腔黑名单 |
| P4 保守度差 | 自己稿 vs 真人稿的强度差，0–3 分打分取均值 | 每日沉淀对比表 |
⚠️ 元规则：指标服务于表述，不反过来约束表述。 若 P4 显示过保守，而某个机检指标（如 hedge 密度）显示「达标」——以 P4 为准，把 hedge 降下来； 不得以「机检已达标」为由回退表述强度。提取顺序也不可颠倒：问题表述 → 地道句式 → 衔接范式 → 量化基线 → AI 腔黑名单。
取样不设领域门槛——生信／组学只是其中一类；药理与药物化学、临床试验与真实世界、动物模型与在体、免疫机制与炎症、分子机制与信号通路、纳米递送、中药与天然产物等同样纳入。落地在 10 个检索块：
| B1 生信核心 | B2 组学测序 | B3 算法建模 | B4 公共数据 | B5 纯生信标志物 |
|---|---|---|---|---|
| B6 药理与药物化学 | B7 临床研究与真实世界 | B8 动物模型与疾病模型 | B9 免疫机制与炎症 | B10 分子机制与信号通路 |
- 检索与筛选必须成对改：只加检索块不补
TAGS标签，新找回的文章会全部卡在相关性门槛被剔除。 - 生信基本盘保底
--min-bioinfo-ratio 0.25：某窗口命中生信核心 13 标签的篇数低于阈值时自动补回（常规窗口实测约 82%，只在异常窗口兜底）。 - 代价：单周候选 6,689 → 10,279（+54%），日课抓取约 4 → 6 分钟。压成本请调
--max-per-block，不要删 B6–B10。
- 量化去 AI 味：把「有点 AI 感」变成可测量的指标 —— 连接词密度、强化词/限制语比、句长分布与标准差、短句占比、AI 模板短语命中数。并提供章内基线（引言 24.2 词/短句 16.7%、讨论 23.9/16.5%、方法与结果 21.0/33.4%），按章节对齐而非用单一平均值。
- 结构规则来自统计：IMRAD 规则不是泛泛而谈，而是从全文实测得出（如 Methods 子标题 99% 为名词短语、Results 子标题在 IF>3 期刊约半数写成论断句、91% 的论文把局限写在 Discussion 正文且平均 9.7 句）。
- 红线可执行：禁止编造数据与文献；未实测数值必须写
[TO BE MEASURED]；IF 抓不到一律PENDING不估算；官方 JIF 与代理指标严禁混称；交付前强制占位符扫描。 - 真实踩坑记录：内置若干会导致数据静默错位的陷阱及其修复（PubMed
ArticleIdList递归命中参考文献导致 DOI/PMCID 错位；期刊指标站搜索兜底返回静态列表污染整表；刊名白名单里的期刊因 IF 表缺条目而整批静默消失；占比类指标用错判定口径会指向反向决策；长任务崩溃点恰好落在 meta 出口）。
在 WorkBuddy 中打开【技能管理】或【专家 → 技能市场】搜索 SCI-writing-VIP，一键安装。
git clone https://github.com/speetle/SCI-writing-VIP.git
mkdir -p ~/.workbuddy/skills
cp -r SCI-writing-VIP ~/.workbuddy/skills/安装后目录结构应为：
~/.workbuddy/skills/SCI-writing-VIP/
├── SKILL.md
├── README.md
├── CHANGELOG.md
├── references/
│ ├── daily-sop.md
│ ├── weekly-sop.md
│ ├── imrad-anatomy-protocol.md
│ ├── language-extraction-protocol.md
│ ├── harvest-protocol.md
│ ├── deep-dissection-protocol.md
│ ├── reading-depth.md
│ ├── anti-ai-checklist.md
│ ├── writing-craft-taxonomy.md
│ └── templates/
└── scripts/ # 20 个脚本，除 report_md_to_docx.py 外全部为标准库实现
依赖：Python 3.9+。仅 scripts/report_md_to_docx.py 需要 python-docx：
python3 -m venv ~/.sci-vip-venv
~/.sci-vip-venv/bin/pip install python-docx安装后直接用自然语言触发：
| 你说 | 它做什么 |
|---|---|
| 「跑今天的文献训练」 | 日课七阶段全流程（静默执行，只落盘） |
| 「本周热点是什么」 | 周课最先产出《本周热点》一页四块 |
| 「跑本周前沿快报」 | 检索层建周池 → 周课 ⑧ 出 Word 报告（热点固定近 2 年） |
| 「拆解这批论文的 IMRAD 架构」 | 周课 ⑨ 50 篇扫面 + 2 篇全文深拆（优先从顶刊 reserve 池取） |
| 「从顶刊池重新建一次 reserve 池」 | harvest_toppool.py --start 2016/01/01 --end 2026/09/30 --per-year 45 |
| 「帮我看这篇稿子有没有 AI 味」 | 复用模式：加载历史积累 + 双样本量化对照 + 三列改写建议 |
| 「帮我设计这篇论文的大纲」 | 按通用写作框架模板逐段生成 |
建议首次使用：先在一个空目录里跑一次「本周文献训练」，让技能建立自己的周池与语言范式库。后续每周的积累会持续叠加。
技能默认在 ~/Documents/SCI-Writing-VIP/ 建立项目目录。若要改路径，在调用时指定，或在自动化任务的 cwds 中设定工作目录。
本仓库的同步脚本可直接复用到别的 skill：scripts/push_skill_to_github.py 走 GitHub Git Data API，
默认不 prune（远端有、本地无的文件不删），仓库自有文件（README / CHANGELOG / LICENSE / docs / .gitignore）在保护名单内，
推送前打印差异清单，逐文件 sha 比对校验。用法：
export GH_TOKEN=ghp_xxx
python3 scripts/push_skill_to_github.py \
--skill ~/.workbuddy/skills/SCI-writing-VIP \
--repo speetle/SCI-writing-VIP \
--msg "feat: v2.4 — 三层取材 + 问题表述训练 + 领域扩至全生物医药"- 本技能是写作训练与辅助工具，不替代研究者的科学判断与署名责任。
- 训练稿带有「不得投稿」警示块，请勿直接投稿。
- 文献指标（影响因子等）来自第三方聚合站点，非 JCR 官方导出，仅供分层参考；代理指标一律明确标注。
- 刊名硬门槛豁免的条目 IF 为
PENDING，引用这批文献时不得写出 IF 数值。 - 请遵守所在机构与出版方的文献使用与版权规定。
MIT License，见 LICENSE。变更记录见 CHANGELOG.md。