algorithm changes

code/adduct_config.txt

@@ -0,0 +1,49 @@
+# ============================================================
+# MPACT 加合物 / 中性丢失(在源裂解)归组 配置
+# 负离子模式 | 乙腈水 + 乙酸铵 + 氨水 (碱性 HILIC)
+# 放在 code 文件夹(和 main.py 同目录)。改完保存,重跑生效。
+# ============================================================
+
+enable = True
+mode = neg
+ppm = 3
+corr_cut = 0.75
+corr_p = 0.05
+mass_defect = True
+md_halogen = False
+
+# ============================================================
+# 离子形式:质量差相对 [M-H]-,单位 Da
+# 加合为正,中性丢失为负。不用的行首加 # 即可
+# ============================================================
+
+# --- 加合物 ---
+M+Hac-H,      60.0211
+M+Cl,         35.9767
+
+# --- 中性丢失 / 在源裂解 ---
+M-H2O-H,     -18.0106
+M-2H2O-H,    -36.0211
+M-CO2-H,     -43.9898
+M-CO-H,      -27.9949
+M-SO3-H,     -79.9568
+M-H2SO4-H,   -97.9674
+M-GlcA-H,   -176.0321
+M-Hex-H,    -162.0528
+M-Taurine-H,-125.0147
+
+# --- 备用(需要时取消注释)---
+# M+Na-2H,     21.9819
+# M+K-2H,      37.9559
+# M+Cl37,      37.9737
+# M+FA-H,      46.0055
+
+# ============================================================
+# 备注:
+# - 同位素 / 振铃 / 二聚体 由 relfil 处理,不在这里配置
+# - [M+Cl]- 来自样品基质,不是流动相
+# - Cl 的质量亏损 -0.031,质量亏损下界 -0.03,刚好卡边界。跑完查
+#   iondict 里 pass_mdfil=False 的离子有无成对相差 35.9767 的,
+#   有就把 md_halogen 改成 True 重跑
+# - 37Cl 与 35Cl 差 1.9971,不是 1.0034 的整数倍,relfil 抓不到
+# ============================================================