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fix technical details in handout translation #121

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Nov 7, 2025
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fix technical details in handout translation #121

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efc9fd2
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avallecam Nov 7, 2025
05f7d8f
fix translation
avallecam Nov 7, 2025
863e1d2
fix format section number and length of spaces
avallecam Nov 7, 2025
e6a6607
add date and format
avallecam Nov 7, 2025
2f14074
increase size inside table
avallecam Nov 7, 2025
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7 changes: 4 additions & 3 deletions learners/files/hands-on.tex
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Expand Up @@ -44,15 +44,15 @@ \section{SEIR Model}
\section{\( R_0 \)}
\( R_0 \) helps project the potential
size of an epidemic and calculate the herd immunity threshold.
It is defined as the average number of secondary \underline{\hspace{2cm}} generated from a primary case in a completely
\underline{\hspace{3cm}} population.
It is defined as the average number of secondary \underline{\hspace{2cm}} generated from a primary infection in a completely
\underline{\hspace{2.5cm}} population.

\section{\( R_t \)}
\( R_t \)
helps monitor the progress of the epidemic.
When the population is no longer \underline{\hspace{2cm}}, the instantaneous
reproduction number \( R_t \) is used. This is defined as the average number
of s\underline{\hspace{2cm}} in a population composed of
of \underline{\hspace{3cm}} in a population composed of
\underline{\hspace{2cm}} and non-\underline{\hspace{2cm}} individuals at time \( t \).

\section{A Diagram for Measles outbreak}
Expand Down Expand Up @@ -187,6 +187,7 @@ \section{Table of parameters}
% \usepackage{booktabs}
\begin{table}[htb]
\centering
\renewcommand{\arraystretch}{1.3}
\addtolength{\leftskip} {-2cm}
\addtolength{\rightskip}{-2cm}
\begin{tabular}{@{}lll@{}}
Expand Down
58 changes: 35 additions & 23 deletions learners/files/out_fr.qmd
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Expand Up @@ -2,9 +2,12 @@
title: "Introduction simple à la modélisation mathématique des maladies infectieuses"
author: "Andree Valle Campos et Abdoelnaser M Degoot \nÉquipe Epiverse-TRACE @ LSHTM"
license: "CC-BY"
date: last-modified
date-format: long
format:
pdf:
toc: false
number-sections: true
include-in-header:
text: |
\usepackage{fancyhdr}
Expand All @@ -28,26 +31,26 @@ Cet exercice vise à évaluer votre compréhension des principes fondamentaux de

Il y a quatre compartiments dans un modèle SEIR: ($S$, $E$, $I$, $R$) :

- $S$ signifie ____, ce qui veut dire ____.
- $S$ signifie ________, ce qui veut dire ________.

Le paramètre qui décrit la transition du compartiment ($S$) vers ($E$) est ____.
- $E$ signifie ____, ce qui veut dire qu’il peut ____.
- $E$ signifie ________, ce qui veut dire qu’il peut ____.

Le taux qui décrit la transition de ($E$) vers ($I$) est le taux de ____.
- $I$ signifie ____, ce qui veut dire qu’il peut ____.
- $I$ signifie ________, ce qui veut dire qu’il peut ____.

Le taux qui décrit la transition de ($I$) vers ($R$) est le taux de ____.
- $R$ signifie ____. Ce compartiment inclut les individus qui ont cessé d’être infectieux et ont acquis une immunité contre l’infection, quel que soit le cours clinique.
- $R$ signifie ________. Ce compartiment inclut les individus qui ont cessé d’être infectieux et ont acquis une immunité contre l’infection, quel que soit le cours clinique.

# $R_0$

$R_0$ aide à projeter la taille potentielle d’une épidémie et à calculer le seuil d’immunité collective.
Il est défini comme le nombre moyen de ____ cas secondaires générés par un cas primaire dans une population complètement ____.
Il est défini comme le nombre moyen de ________ secondaires générés par un infection primaire dans une population complètement ________.

# $R_t$

$R_t$ aide à suivre la progression de l’épidémie.
Lorsque la population n’est plus ____, on utilise le nombre de reproduction instantané $R_t$.
Il est défini comme le nombre moyen de ____ dans une population composée d’individus ____ et non ____ au temps $t$.
Lorsque la population n’est plus ________, on utilise le nombre de reproduction instantané $R_t$. Il est défini comme le nombre moyen de ____________ dans une population composée d’individus ________ et non ________ au temps $t$.

# Un diagramme du modèle SEIR

Expand Down Expand Up @@ -172,22 +175,31 @@ Un paramètre dans un modèle de transmission correspond à une propriété biol
Veuillez remplir le tableau ci-dessous avec les paramètres décrits ci-dessus. De plus, notez que nous exécuterons la simulation pendant 120 jours.


| Paramètre | Valeur | Définition |
|:------------------------:|:------:|:-----------:|
| `bf_pop` | ___ | Taille de la population |
| `S/N` | ___ | Proportion de personnes sensibles |
| `E/N` | ___ | Proportion de personnes exposées |
| `I/N` | ___ | Proportion de personnes infectieuses |
| `R/N` | ___ | Proportion de personnes rétablies |
| `V/N` | ___ | Proportion de personnes vaccinées |
| `r0` | ___ | Nombre de reproduction de base |
| `latent_period` | ___ | Temps entre l'infection et le début de la contagiosité (jours) |
| `infectious_period` | ___ | Durée de la période de contagion (jours) |
| `transmission_rate` | ___ | Taux auquel les individus infectieux infectent les personnes sensibles (r0 / infectious_period) |
| `infectiousness_rate` | ___ | Taux de progression des exposés vers les infectieux (1 / latent_period) |
| `recovery_rate` | ___ | Taux de progression des infectieux vers les rétablis (1 / infectious_period) |
| `time_end` | ___ | Nombre maximal d'unités de temps pour la simulation (jours) |
| `increment` | ___ | Taille de l'incrément de temps (jours) |
\begin{table}[htb]
\centering
\renewcommand{\arraystretch}{1.3}
\addtolength{\leftskip} {-2cm}
\addtolength{\rightskip}{-2cm}
\begin{tabular}{@{}lll@{}}
\toprule
Paramètre & Valeur & Définition \\ \midrule
bf\_pop & \underline{\hspace{1cm}} & Taille de la population \\
S/N & \underline{\hspace{1cm}} & Proportion de personnes susceptibles \\
E/N & \underline{\hspace{1cm}} & Proportion de personnes exposées \\
I/N & \underline{\hspace{1cm}} & Proportion de personnes infectieuses \\
R/N & \underline{\hspace{1cm}} & Proportion de personnes rétablies \\
V/N & \underline{\hspace{1cm}} & Proportion de personnes vaccinées \\
r0 & \underline{\hspace{1cm}} & Nombre de reproduction de base \\
latent\_period & \underline{\hspace{1cm}} & Temps entre l'infection et le début de la contagiosité (jours) \\
infectious\_period & \underline{\hspace{1cm}} & Durée de la période de contagion (jours) \\
transmission\_rate & \underline{\hspace{1cm}} & Taux auquel les individus infectieux infectent les susceptibles (r0/infectious\_period) \\
infectiousness\_rate & \underline{\hspace{1cm}} & Taux de progression des exposés vers les infectieux (1 / latent\_period) \\
recovery\_rate & \underline{\hspace{1cm}} & Taux de progression des infectieux vers les rétablis (1 / infectious\_period) \\
time\_end & \underline{\hspace{1cm}} & Nombre maximal d'unités de temps pour la simulation (jours) \\
increment & \underline{\hspace{1cm}} & Taille de l'incrément de temps (jours) \\ \bottomrule
\end{tabular}
\end{table}




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